En 1648, la plus grande partie de la province était divisée entre les Habsbourg, archiducs d'Autriche et Empereurs du Saint-Empire (seigneuries de Marimont, Altkirch, Thann, Belfort), les Princes-Evêques de Strasbourg (Saverne, Molsheim, Benfeld), les Comtes de Hanau-Lichtenberg (Bouxwiller, Woerth, Ingwiller), la maison Palatine (comtés de la Petite Pierre, de Ribeaupierre), la République de Strasbourg (Barr, Wasselonne).
[[Fichier:1747 La Feuille Map of Rhineland, Germany - Geographicus - Rhein-lafeuille-1747.jpg|thumb|right|400px|1747]]
<br />De 1673 à 1681, le Roi de France Louis XIV assure sa suzeraineté sur le reste du pays, et en dernier lieu à Strasbourg (1681).
le Traité de Nimègue, en 1679, confirme les droits de Louis XIV sur l'Alsace. Les Intendants du Roi administrent la province.
<br />A Colmar, le Conseil Souverain, parlement, juge les affaire de la région.[[Fichier:1747 La Feuille Map of Rhineland, Germany - Geographicus - Rhein-lafeuille-1747.jpg|thumb|right|400px|1747]]
Au XVIIIe siècle, Vauban édifie des forteresses le long du Rhin (Strasbourg, Sélestat, Neuf-Brisach, Huningue, ainsi que Belfort), et assure la sécurité de l'Alsace.