Percée au commencement du XIII{{e}} siècle, elle fut primitivement dénommée rue des Bouliers ou au Bouloir et rue de Richebourg. Elle a porté aussi le nom de [[Rue Neuve d'Orléans (5e)|rue Neuve d'Orléans]] et rue d'Orléans.
Louis Jean -Marie D'Aubenton, dit Daubenton (1716-18001799), naturalisteet médecin, voisinage directeur du [[Jardin des Plantes de Paris|Jardin des Plantes]], ou l'[[allée Daubenton]] lui rend également hommage.